- 本廟將以慈善為主要宗旨，不以營利為主要目的，以媽祖的慈愛與慈悲作為營運的中心思想。未來寺廟的財務將採取透明公開，定期公佈財務報表，以期善心人士更願意拋磚引玉，安心捐獻，回饋社會。
- 本廟不會藉由以媽祖為名義或其他任何名義的組織募款或勸誘捐款，信徒的發心或捐獻都將出自於個人意願。信徒可有錢出錢，有力出力，共同發揚媽祖慈悲與大愛的精神，讓東京媽祖廟永續經營下去，成為大家心靈的寄託所在。
- 成為台灣僑胞的宗教信仰中心與心靈寄託
宗教與信仰帶給大家的，是非常正面的安定的力量，特別是長期旅居或移民於日本的僑胞，非常思念家鄉與家人，希望這一座充滿台灣文化與氣息的媽祖廟，帶給大家宗教信仰與心靈的安定力量。 - 成為台灣與日本文化交流的中心
從去年東北大地震可看到，於天災襲擊後，台灣人民給予的關心以及友善的表現，我們深信兩國的文化都傳承著中國悠久歷史文化的薰陶。希望藉由媽祖的慈愛與媽祖柔軟優美文化的交流，促進兩國民間的文化交流。 - 給予台灣僑胞一個”家”的感覺與互相交流的場所
在日台灣僑胞應該要有一個前後輩互相關心與交流的場所，尤其是剛到日本生活不適應，或日常生活所需的幫助都是必要的，有一個這樣的場所，可以讓後輩更快適應外地的生活與相互幫助。
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